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  Curso: "Introducción a la MORFOMETRÍA GEOMÉTRICA"



Página Web para el curso vigente:  http://www.filogenetica.org/cursos/Morfometria/

Morfometría Geométrica

 

Postgrado CIECO, UNAM

Morelia, México. 16 al 20 de Octubre 2006

 

Profesores:

Dr. Efraín De Luna,

Depto. Biodiversidad y Sistemática, INECOL, Xalapa, Ver

Dr. Antonio Guerrero Enriquez,

Fac. de Ciencias Biológicas, UAEM, Cuernavaca, Mor

Dr. Luis Mendoza Cuenca

Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Morelia, Mich

 

Contenido:

Programa. Horarios para las sesiones diarias (PDF).

Clases. Presentaciones en PDF.

Referencias. Lista de lecturas para las clases (algunas disponibles en PDF)

Libros.

Software para el curso.

Enlaces a sitios web.


Clases

0. Presentación del curso de Morfometría Geométrica

Clase 1 Introducción

Clase 2 Hipótesis. Conceptos de probabilidad, valores, escalas y medidas.

1. Imágenes

Clase 3 Captura de imágenes. Pixeles. Digitalización de grises, color, equipo y formatos.

Clase 4 Despliegue de Imágenes. Deformaciones, pixeles, resolución, monitores.

Clase 4b Análisis de Imágenes. Mejoramiento digital, brillo, contraste, filtros, foco.

Clase 5 Pixeles. Detección automatizada de contornos, dimensiones, coordenadas.

Clase 6 Registro. Distancias, contornos, coordenadas.

2. Geometría y Estadística

Clase 7 Vectores. Geometría de vectores, suma, producto, combinación lineal.

Clase 7b Vectores. Configuración por distancias, contornos y coordenadas.

Clase 8 Espacios. Geometría de configuración, espacio de ajuste, superimposiciones.

Clase 9 Ajustes. Eigenanalisis, varianza total y proyecciones.

Clase10 Proyecciones. Coordenadas Procrustes, relative warps, TPS y visualización del cambio relativo de forma.

Clase 11 Variación. Vectores y escalares, varianza, modelos lineales y errores.

Clase 11b Resumen de estadistica. Correlación, regresión, varianza, covarianza, varianza total

Clase 12 Regresión. Estimación, validación, errores, regresión geométrica, RMA y aplicaciones

Clase 13 Métodos de ordenación. PCA. rotaciones rígidas.

Clase 14 Métodos de ordenación. CVA. rotaciones no rígidas.

Clase 15 Finale. Combinando técnicas de registro y herramientas de análisis.

Diagrama de la ruta de programas y archivos. (PDF)

3. Aplicaciones

Lista de artículos seleccionados para leer y revisar en clase (PDFs). Familiarícese al menos con uno de los casos. No estamos seguros como andaremos de tiempo, pero ojala al menos podamos revisar tres o cuatro casos.

Tiene Ud. un articulo en PDF que quisiera sugerir? Envíemelo por email y lo depositamos aquí para compartirlo.

Hojas de Acer

cráneos

cráneo de Homo

variación de caracteres

alometría

alometría 2

diatomeas

polimorfismo

fourier vs distancias

heredabilidad

disparidad

marmotas

dimorfismo sexual

distinción de especies

Software para el curso (aplicaciones para Windows)

tpsDig.

IMP Software.

Instrucciones para instalar IMP (PDF).

PAST. Paleontological Statistical Analysis.


Enlaces

Bibliography. (PDF). From the book: Geometric Morphometrics for Biologists. A primer. Zelditch, Swiderski & Fink.

Introduction. (PDF). From same book. {Además de una buena introducción al tema, contiene las instrucciones para instalar IMP}

Glossary. (PDF). From same book.

PAST User Manual. Excelente introducción a conceptos y las operaciones para hacer los análisis estadísticos. (en PDF).

Análisis de imágenes

CMIS Research - Image Analysis

IAG Applets

I-CUBE Image Analysis Image Processing for Scientific Research and Industrial Applications

Image Analysis and Understanding Homepage

Image Analysis Systems and Software for tree-ring, wood cell, root, seed, needle, broad leaf and canopy analysis and measurement

Image NIH Home Page

ImageJ Basic Concepts

ImageJ tutorial AERFAI

Image Processing

Laboratory of Image Analysis Home Page

MCID & MCID Analysis software solutions for the life sciences.

Introducing CombineZ3

MorphoXpress. Morfometria vertebral.

PAXit - Image Analysis Software

Más Software

Image NIH

ImageJ

Image ProPlus-Media Cybernetics

IMP Software More

Mauro J. Cavalcanti - Software Disponível

Software. Morphometrics at SUNY Stony Brook

General

Análisis Cuantitativo en Arqueología

Applied Statistics

Morfometría Geométrica

Modern Biometry

SB morphometrics

Morphometrics in Medical Entomology

Buscar más libros de Morfometria en Amazon.com

Participantes

 

 

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Editor: Efraín De Luna, Depto. de Biodiversidad y Sistemática, INECOL , AC.

Creado:  Julio, 2006. Modificado: 09 Jun 2009