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Curso: "Genética de la Conservación"

Programa de Doctorado Institucional en Ciencias Biológicas de la

Universidad Michoacana de San Nicolás Hidalgo, Morelia.

 

Bienvenid@s a la página web del curso!       

Como parte del programa de Doctorado Institucional de la Universidad he desarrollado un curso sobre Genética de la Conservación para alumnos de posgrado. Es importante hacer notar que en la actualidad múltiples herramientas de análisis filogenético son usados para fines de conservación de especies amenazadas.

 

Profesor:

Dr. Adrián Quijada Mascareñas
Laboratorio de herpetología, Facultad de Biología
Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo (UMSNH).
Ciudad Universitaria, Morelia, Michoacán, México
Office Tel: +52 (443) 322 35 00, Ext. 4213
Email: adrianquijada@hotmail.com
aquijada@zeus.umich.mx

 

 
  
  
  
  
  
  

Programa para la materia de:

 Genética de la Conservación

 Carga horaria: 4 horas semanales.

Fecha de elaboración: Marzo 2006

Curso desarrollado e implementado por:

Dr. Adrián Quijada Mascareñas

 (PhD 2005, School of Biological Sciences, University of Wales, United Kingdom)

 

Perfil: Ecólogo molecular interesado en la biología evolutiva y biogeografía de anfibios y reptiles. Su estudio doctoral se enfocó en la evolución de los Neotrópicos durante el Cuaternario utilizando a las serpientes de cascabel como sistema de estudio. Su investigación se ha centrado también en la conservacion genetica de especies amenazadas o  en peligro de extincion. Actualmente se encuentra trabajando en la filogeografía y sistemática molecular de lagartijas y serpientes del norte de México.

Cuenta con 27 artículos publicados en revistas arbitradas, 6 de difusión y  10 capítulos de libro. Actualmente se encuentra trabajando en el libro “Cascabeles de México: retrato de un icono biológico y cultural” y en un capitulo de libro sobre estudios filogeográficos en la cuenca del Amazonas que será publicado por Blackwell publishing.

Algunos artículos recientes:

Quijada-Mascareñas A., J.E. Ferguson, C.E. Pook, M.G. Salomão, R.S. Thorpe, & W. Wüster (2007) Phylogeographic patterns of Trans-Amazonian vicariants and Amazonian biogeography: The Neotropical rattlesnake (Crotalus durissus complex) as an example. Journal of Biogeography 34: 1296–1312.

Quijada-Mascareñas A. & W. Wüster (2006) From Yucatan to Patagonia: the natural history of the Neotropical rattlesnake, Crotalus durissus. Reptilia 49: 66-73.

Wüster, W., J.E. Ferguson, A. Quijada-Mascareñas, C.E. Pook, M.G. Salomão & R.S. Thorpe (2005) Tracing an invasion: landbridges, refugia and the phylogeography of the Neotropical rattlesnake (Serpentes: Viperidae: Crotalus durissus). Molecular Ecology 14: 1095-1108.

 

Fecha de la última revisión (Mes / año): Julio 2007

 

INTRODUCCIÓN

La World Conservation Union (IUCN), la organización primaria en conservación biológica internacional, reconoce la necesidad crucial de conservar la diversidad genética como uno de los tres niveles fundamentales de biodiversidad. Este curso provee de los conceptos y métodos de análisis requeridos para entender la importancia de los factores genéticos en la extinción de especies y los medios para amortiguar sus efectos.

 

La genética de la conservación comprende las siguientes actividades:

 

  • Manejo genético de poblaciones pequeñas para retener su diversidad genética y minimizar la endogamia.

  • Resolver las inconsistencias taxonómicas y la delineación de las unidades de manejo.

  • El uso de análisis genético y molecular en análisis forense de vida silvestre y una mejor comprensión de la biología de los organismos.

 

El presente curso hará uso de ejemplos provenientes de la literatura para ejemplificar la teoría y los distintos enfoques de que se ha valido la genética de la conservación en el planteamiento de problemas donde la disminución de la variación genética ha producido serios efectos en las poblaciones naturales. Al final del curso, el alumno será capaz de identificar problemáticas locales y nacionales en la conservación de especies que podrían requerir el uso de las herramientas y análisis de la genética de la conservación.

 

OBJETIVOS

 

Objetivo general:

Introducir al alumno en la teoría y práctica de la genética de la conservación.

 

Objetivos Particulares:

 

           I.     El alumno comprenderá la importancia de la variación genética en el origen y perpetuación de las especies.

         II.     El alumno identificara los principales factores naturales y antropogénicos que han causado la disminución de la variación genética y su vinculo con al extinción.

       III.     El alumno será familiar con los diversos métodos de manejo de vida silvestre enfocados a disminuir la perdida de variación genética.

       IV.     El alumno será familiar con la metodología y análisis de variación genética de especies en peligro, tanto de las técnicas de laboratorio como de herramientas analíticas.

 

CONTENIDO DEL PROGRAMA

1.    Introducción.

1..1.       La sexta extinción.

1..2.       Conservación de la biodiversidad.

1..3.       Especies en peligro y extintas.

1..4.       Que es una especie amenazada?

1..5.       Causas de la extinción.

1..6.       Genética de la conservación.

2.     Diversidad genética.

2..1.       Importancia de la diversidad genética.

2..2.       Medidas de la diversidad genética.

2..3.       El equilibrio de Hardy-Weinberg.

2..4.       Diversidad genética baja en especies amenazadas.

2..5.       Evolución y diversidad genética.

3.     Genética evolutiva de poblaciones naturales.

3..1.       Factores que controlan la evolución de las poblaciones.

3..2.       Mutación.

3..3.       Migración y flujo génico.

3..4.       Selección natural y adaptación.

3..5.       Interacciones genotipo-ambiente.

3..6.       Balance entre mutación y selección.

4.     Las consecuencias genéticas de la disminución del tamaño de la población.

4..1.       El tamaño de la población en la genética de la conservación.

4..2.       Perdida de la diversidad genética.

4..3.       Efectos aleatorios y deriva génica.

4..4.       Efectos de la restricción del tamaño de las poblaciones.

4..5.       Endogamia.

4..6.       Medidas del tamaño poblacional.

4..7.       Fragmentación de poblaciones.

4..8.       Selección natural en poblaciones pequeñas.

5.     Genética de la extinción.

5..1.       Genética de las especies amenazadas.

5..2.       Depresión endogamica.

5..3.       Medidas de la depresión endogamica.

5..4.       La relación entre la depresión endogamica y la extinción.

5..5.       Perdida de diversidad genética y extinción.

5..6.       Poblaciones genéticamente viables.

5..7.       Análisis de viabilidad poblacional

6.     Taxonomia y la definición de las unidades de manejo.

6..1.       La importancia de la taxonomia en conservación.

6..2.       El concepto de especie y subespecie.

6..3.       Uso del análisis genético para delimitar especies.

6..4.       Distancia genética.

6..5.       Análisis filogenético y Filogeografia.

6..6.       Depresión por hibridación.

6..7.       Definiendo unidades de manejo dentro de especies.

7.     Manejo genético de especies amenazadas en el campo.

7..1.       Problemática  genética de  especies amenazadas.

7..2.       Aumentando el tamaño poblacional.

7..3.       Diagnostico de problemas genéticos.

7..4.       Restaurando poblaciones con baja variación genética.

7..5.       Manejo genético de poblaciones fragmentadas.

7..6.       Aspectos genéticos del diseño de reservas.

7..7.       Manejo de la hibridación.

7..8.       Impactos genéticos  de la extracción en poblaciones.

7..9.       Evaluación de la recuperación genética de poblaciones.

7..10.   Tecnologías reproductivas para la recuperación de poblaciones.

8.     Reintroducción y reproducción en cautiverio.

8..1.       Reproducción en cautiverio.

8..2.       La reproducción en cautiverio y la reintroducción.

8..3.       Establecimiento de poblaciones en cautiverio.

8..4.       Crecimiento de poblaciones en cautiverio.

8..5.       Manejo genético durante la fase de mantenimiento.

8..6.       Manejo de enfermedades hereditarias.

8..7.       Reintroducción en poblaciones naturales.

8..8.       Ejemplos de reproducción en cautiverio y reintroducción.

9.     Genética molecular en el análisis forense de vida silvestre.

9..1.       Análisis forense: detectando cacería y colecta ilegal.

9..2.       Árboles de genes y coalescencia.

9..3.       Tamaño poblacional e historia demográfica.

9..4.       Estructura poblacional y flujo génico.

9..5.       Reintroducción y reubicación de poblaciones.

9..6.       Sistemas de apareamiento y  paternidad.

9..7.       Enfermedades.

9..8.       Dieta.

10.  Genética de la conservación en México.

10..1.   Seminarios sobre estudios de caso.

10..2.   Hacia una red de análisis forense de vida silvestre.

10..3.   Conclusiones.

CORRELACIÓN CON OTRAS MATERIAS

El curso de relaciona ampliamente con los programas y contenidos relacionados con el manejo y conservación de recursos naturales, constituyendo el rubro de aplicación de otras materias como genética, genética de poblaciones, manejo de recursos naturales, evolución, biogeografía, botánica y zoología. Aunque el curso esta diseñado para programas de posgrado, la simplicidad así como el hecho que se requiere conocimientos del tronco básico de la licenciatura, hace posible que estudiantes de licenciatura como de otras carreras como las relacionadas con Veterinaria estén altamente interesados.

METODOLOGÍA Y DESARROLLO DEL CURSO

La dinámica del curso será de manera tradicional con exposición del temario por parte del profesor a cargo y complementando con ejercicios y lecturas de artículos relacionados. Se hará uso de material audiovisual y en algunas partes del temario de presentación de seminarios por parte de los alumnos auxiliándose de material audiovisual.

SISTEMA GENERAL DE EVALUACIÓN

Para evaluar el curso se pondrá a consideración la entrega de ensayos, asistencia al curso y participación activa de los alumnos. Al final del curso y como parte del ultimo tema, se les pedirá una breve exposición de un caso local o nacional donde se haya aplicado herramientas relacionadas con la genética de la conservación, e incluso se podrán incluir temas de investigación que los mismos alumnos propongan como futuros proyectos de investigación y aplicación.

BIBLIOGRAFÍA*

  • Richard Frankham, Jonathan D. Ballou, and David A. Briscoe. 2002. Introduction of Conservation Genetics. Cambridge University Press. 640 paginas.

  • Fred W. Allendorf and Gordon Luikart. 2006. Conservation and the Genetics of Populations. Blackwell Publishing, 592 paginas.

  • J.C. Avise and J.L. Hamrick. 1996. Conservation Genetics. Springer, 536 páginas.

  • J.C. Avise. Molecular Markers, Natural History, and Evolution. Sinauer Associates, 684 paginas.

  • Andrew G. Young, Geoffrey M. Clarke, Guy Cowlishaw, and Rosie Woodroffe. 2000. Genetics, Demography and Viability of Fragmented Populations (Conservation Biology). Cambridge University Press, 456 paginas.

 

*Se complementara estas referencias básicas con artículos relacionados en cada uno de los temas.

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Editor: Efraín De Luna, Depto. de Biodiversidad y Sistemática, INECOL , AC.

Creado:  Julio, 2006. Modificado: 17 Mar 2009