Curso de Postgrado:

"Introducción a la MORFOMETRÍA GEOMÉTRICA"

Edición 2

 

Abril 19 al 23, 2010

Lugar:

Edificio de Posgrado, División de Ciencias Biológicas y de la Salud,

Departamento de Biología,

UAM Iztapalapa. México DF.

 


Inicio   Programa   Clases (PDFs)   Referencias   Libros   Software  Imágenes  Enlaces


Programa de Clases

semana del 19 al 23 de Abril, 2010

versión en PDF

 

 TemaDiaHorario
  Lunes 
 Bienvenida por parte de las autoridades de la DCBS.  8:30 am
0. Presentación del curso 9:00 am
 Clase 1 Introducción (13 pp). Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica.  9:15
 Clase 2 Aplicación de métodos de la morfometría geométrica en Biología. Estudios de caso en ecología evolutiva, sistemática, otros campos. 9:45
 

receso (15 mins)

 10:45
1. Datos  
 

Clase 3 Hipótesis (19 pp). Conceptos de probabilidad, espacios, modelo Normal, escalas, medidas, precisión, exactitud, error.

 11:00
 

comida (60 mins)

 1:00  pm
 Clase 4 Registro (xx pp).  Marcas: criterios y tipología. Semimarcas: contornos. Matrices de configuración. 12:00
 

Lab 1: Software para registro y análisis (tpsDig, IMP, PAST)

Lab 2: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig, MakeFan.

 

3:00

4:00

 Comentarios finalestodos4:50
  Martes 
2. Geometría y Estadística  
 Clase 5 Vectores (22 pp). Espacios, Geometría de vectores, Teorema de Pitágoras. Suma, combinación lineal. Producto, ortogonalidad, base ortonormal, rotación. 9:00 am
 Clase 6 Espacios (26 pp). Distancias. Coordenadas. Geometría de configuración, hiperesfera, espacios de ajuste, superposición, planos de proyección. 10:00
 

receso (15 mins)

 10:45
 Lab 3: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig, MakeFan 11:00
 Clase 7 Ajuste por Superposición (18 pp). Espacio de las coordenadas. Métodos de superposición. Análisis de Procrustes. Espacio de Kendall, manifolds y distancias Procrustes. 12:00
 

comida (60 mins)

 1:00  pm
 

Lab 4: Métodos de Superimposiciones. Software: IMP Coordgen.

 3:00
 Comentarios finales 4:50
  Miércoles 
3. Análisis morfométricos  
 Clase 8 Proyecciones (18 pp). Espacios tangentes. Coordenadas Procrustes parciales, TPS y su descomposición.  9:00 am
 Lab 5: Métodos de Superimposiciones. Software: IMP Coordgen.  9:45
 

receso (15 mins)

 10:45
 Clase 9 TPS (19 pp). Placa delgada de deformación.  Componentes de la deformación. Eigen-análisis de la matriz de energía de deformación. Partial Warps. Visualización del cambio relativo de forma. 11:00
 !Fotografia oficial del grupo!todos12:30
 

comida (60 mins)

 1:00  pm
 

Clase 10. Proyectos individuales. ¿Qué preguntas tienen?, ¿Cuáles son sus hipótesis? ¿Que tipos de analisis usar?

todos

3:00

 Comentarios finales 4:50
  Jueves 
 Clase 11  Variación (23 pp). Promedio, varianza, covarianza, varianza generalizada, varianza total. Modelos, estimacion y errores. Modelos lineales: regresion, eje principal, componentes principales, variables canónicas. 9:00 am
 Clase 12 Ajustes de distancias (29 pp). Eigen-análisis del espacio de las distancias. Transformación, ortogonalización, normalización, centrado, rotación y proyección. 10:00
 

receso (15 mins)

 10:45
 Clase 13 Métodos de Ordenación. Análisis de Componentes Principales (PCA).  Rotaciones rígidas. 11:00
 Clase 14. Métodos de Ordenación. Análisis de Variables Canónicas (CVA).  Rotaciones no rígidas. Análisis Discriminantes.  Distancias de Mahalanobis. MANOVA. 12:00
 

comida (60 mins)

 1:00  pm
 Lab 6: Métodos de Ordenación. Software: IMP PCAGen, CVAGen. 3:00
 Comentarios finales 4:50
  Viernes 
 Clase 15. Métodos de regresión. Forma vs tamaño. Forma vs función. 9:00 am
 Clase 16. Soluciones prácticas. Presentación de ejemplos con base en los proyectos personales de los participantes, análisis de casos en la literatura y/o exposición de trabajos de los profesores. 10:00 am
 

receso (15 mins)

 10:45
 Lab 7: Integración y evaluación de hipótesis estadísticas y morfométricas 11:00
 

comida (60 mins)

 1:00  pm
 Lab 8: Combinando métodos morfométricos 3:00
 Comentarios finales. Entrega de constancias.  4:00
 Clausura del curso. 4:30