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Curso: "Introducción a la MORFOMETRÍA GEOMÉTRICA"
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Programa de Clases
Tema | |||
Semana 1 | |||
0. | Presentación del curso | ||
Clase 1 Introducción (13 pp). | |||
Clase 2 Hipótesis (19 pp). Conceptos de probabilidad, espacios, modelo Normal, escalas, medidas, precisión, exactitud, error. | |||
1. | Imágenes | ||
Clase 3 Imágenes (32 pp). Tamaño, resolución, niveles, codificación de color. Recomendaciones. Despliegue. Pixeles a puntos de luz, monitores, resolución, tamaño. Ejemplos. | |||
Semana 2 | |||
Clase 4 Registro (11 pp). Contornos, Distancias entre marcas. Software para registro y análisis. Matrices de configuración. | |||
Clase 5 Registro (10 pp). Coordenadas de marcas. Software para registro (tpsDig) y análisis (IMP). Matrices de configuración. | |||
Lab 1: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig | |||
Semana 3 | |||
2. | Geometría y Estadística | ||
Clase 5 Vectores (22 pp). Espacios, Geometría de vectores, Teorema de Pitágoras. Suma, combinación lineal. Producto, ortogonalidad, base ortonormal, rotación. | |||
Clase 6 Espacios (26 pp). Distancias. Coordenadas. Geometría de configuración, espacios de ajuste, planos de proyección. | |||
Lab 2: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig | |||
Semana 4 | |||
Clase 7 Ejemplos (xx pp). Aplicación de métodos de la morfometría geométrica en Biología. | |||
Clase 8 Ajustes 1 (29 pp). Eigen-análisis del espacio de las distancias. Transformación, ortogonalización, normalización, centrado, rotación y proyección. | |||
Lab 3: Métodos de Registro. Software: tpsUtils, tpsDig | |||
Semana 5 | |||
Clase 9 Ajustes 2 (18 pp). Espacio de las coordenadas. Métodos de superposición. Análisis de Procrustes. Espacio de Kendall, manifolds y distancias Procrustes. | |||
Clase 10 Proyecciones (18 pp). Espacios tangentes. Coordenadas Procrustes parciales, TPS y su descomposición. | |||
Lab 4: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen | |||
Semana 6 | |||
Clase 11 TPS (19 pp). Placa delgada de deformación. Componentes de la deformación. Eigen-análisis de la matriz de energía de deformación. Partial Warps. Visualización del cambio relativo de forma. | |||
Lab 5: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen | |||
Lab 6: Métodos de Superposición. Software: IMP CoordGen | |||
Semana 7 | |||
Clase 12 Variación (23 pp). Promedio, varianza, covarianza, varianza generalizada, varianza total. Modelos, estimacion y errores. Modelos lineales: regresion, eje principal, componentes principales, variables canónicas. | |||
Clase 13 Métodos de Ordenación. Análisis de Componentes Principales (PCA). Rotaciones rígidas. | |||
Lab 7: Métodos de Ordenación. Software: IMP PCAGen | |||
Semana 8 | |||
Clase 14. Métodos de Ordenación. Análisis de Variables Canónicas (CVA). Rotaciones no rígidas. | |||
Lab 8: Métodos de Ordenación. Software: IMP CVAGen | |||
Semana 9 | |||
Presentación de artículos | |||
Lab 9: Métodos de Ordenación. Software: IMP CVAGen | |||
Semana 10 | |||
Presentación de Proyectos | |||
Lab 10: Combinando métodos morfométricos | |||